Der Kirchenvorstand (KV) leitet die Angelegenheiten der Petersgemeinde in allen Belangen. Er verantwortet unter anderem das geistliche Leben, Veranstaltungen und Bildungsangebote, Finanzen und Immobilien. Sie erreichen alle KV-Mitglieder unter der Email: kv@peterskirche-leipzig.de.
Der aktuelle KV setzt sich wie folgt zusammen: 
- Michael Büchting
- Michael Friedemann (Vorsitzender)
- Angelica Hoffmeister-zur Nedden
- Dr. Thomas Hoppe
- Dr. David Käbisch-Lepetit
- Juliane Keitel
- Sebastian Kolditz
- Corinna Pietsch
- Silvia Schellenberg-Thaut
- Pfr. Johannes Toaspern (stellv. Vorsitzender)
- Markus Voigt
Neben dem Kirchenvorstand gibt es unterschiedliche Ausschüsse, die sich tiefgreifend mit einem spezifischen Themengebiet befassen. In Ihnen erarbeiten Kirchvorsteher zusammen mit anderen Gemeindemitgliedern Konzepte und Beschlußvorlagen für die Kirchenvorstandssitzungen:
- Finanzen und Verwaltung
- Michael Büchting
- Michael Friedemann
- Andreas Pöge (Vorsitzender)
- Johannes Roth
- Bau
- Kristian Bollmann
- Rüdiger Forchmann
- Dr. Thomas Hoppe
- Andreas Kimme (Vorsitzender; kimme@peterskirche-leipzig.de)
- Sebastian Thaut
- Kinder und Jugend
- Angelica Hoffmeister-Zur Nedden
- Dr. David Käbisch-Lepetit (Vorsitzender)
- Juliane Keitel
- Corinna Pietsch
- Diakonie
- Heidi Becker
- Lieselotte Grimm
- Sebastian Kolditz
- Frau Nonnenberger
- Frau Ziemer
- Gottesdienste, Gemeindebildung und Ökumene
- Prof. Dr. Gottfried Alber
- Juliane Keitel
- Sebastian Kolditz
- Pfr. Johannes Toaspern (Vorsitzender; toaspern@peterskirche-leipzig.de)
- Prof. Dr. Jürgen Ziemer
- Öffentlichkeitsarbeit
- Lieselotte Grimm
- Angelica Hoffmeister-Zur Nedden
- Johanna Lippold
- Corinna Pietsch (Vorsitzende; pietsch@peterskirche-leipzig.de)
Desweiteren bestehen 3 gemeinsame Ausschüsse mit der Schwestergemeinde Bethlehem. Diese sind jeweils paritätisch besetzt. Die Petersgemeinde vertreten:
- Gemeindepädagogik
- Dr. David Käbisch-Lepetit
- Juliane Keitel
- Sivlia Schellenberg-Thaut
- Personal
- Michael Friedemann
- Dr. Thomas Hoppe
- Kirchenmusik
- Michael Büchting (Vorsitzender; buechting@peterskirche-leipzig.de)
- Andreas Kimme
- Corinna Pietsch
In der Bezirkssynode wird die Petersgemeinde durch Heidrun Becker und Markus Voigt vertreten.
